Komplexně zajišťuje koncepci, metodiku a koordinaci finančních veřejnosprávních kontrol.
Vydává roční plán kontrol oddělení a připravuje jednotlivé příkazy k provedení kontrol řediteli úřadu.
Analyzuje výsledky kontrolních zjištění a navrhuje systémová opatření.
Kontroluje hospodaření se svěřeným majetkem a s peněžními prostředky organizačních složek kraje, provádí kontrolu hospodaření včetně nakládání s majetkem a poskytnutými dotacemi a příspěvky u příspěvkových organizací kraje.
Kontroluje poskytnutou veřejnou podporu obcím z rozpočtu kraje.
Odpovídá za výběr vzorku příjemců a řádné provedení následné veřejnosprávní kontroly na místě u příjemců veřejné podpory z prostředků kraje v kontrolních skupinách sestavených z kontrolorů oddělení kontrolního a příslušných zaměstnanců administrujícího odboru. Případně kontroluje využití darů u právnických a fyzických osob.
Provádí následné veřejnosprávní kontroly na místě u vzorků projektů financovaných ze zdrojů EU.
Na základě kontrolních zjištění úřadu a kontrolních zjištění jiných subjektů zajišťuje ukládání odvodů a penále za porušení rozpočtové kázně dle § 22 zákona č. 250/2000 Sb., o rozpočtových pravidlech územních rozpočtů, ve znění pozdějších předpisů, kterých se kontrolované subjekty, mimo příspěvkové organizace zřizované krajem, dopustily od 1. 4. 2009.
Koordinuje vnitřní kontrolní systém kraje prostřednictvím ročních plánů kontrol a provádí jejich vyhodnocování.
Oddělení kontrolní v přenesené působnosti:
Přezkoumává hospodaření obcí a dobrovolných svazků obcí v rámci kraje v souladu se zákonem č. 128/2000 Sb., o obcích (obecní zřízení), ve znění pozdějších předpisů (dále jen „zákon o obcích“), a zákonem č. 420/2004 Sb., o přezkoumávání hospodaření územních samosprávných celků a dobrovolných svazků obcí, ve znění pozdějších předpisů.
Předkládá ministerstvu financí roční zprávu o výsledcích finančních kontrol ve smyslu zákona č. 320/2001 Sb., o finanční kontrole.
Provádí cenovou kontrolu u obcí a ukládá pokuty za porušení cenových předpisů dle zákona č. 265/1991 Sb., o působnosti orgánů České republiky v oblasti cen, ve znění pozdějších předpisů.
Odpovídá za plnění úkolů a činností svěřených úřadu zákonem č. 186/2016 Sb., o hazardních hrách, ve znění pozdějších předpisů.
Dle zákona č. 250/2000 Sb., o rozpočtových pravidlech územních rozpočtů, ve znění pozdějších předpisů, zajišťuje ukládání pokut za přestupky, kterých se dopustila obec nebo DSO; přezkoumává rozhodnutí obecního úřadu a orgánu svazku obcí o uložení odvodu a penále za porušení rozpočtové kázně.